创业者应根据自身的创业项目性质和需求，选择不同的部门进行申请。创业项目涉及到商业经营、知识产权、财务资助等方面，可以选择相关的部门进行申请。

如果创业者需要进行商业注册、税务申报等法律手续，可以向工商管理部门或税务部门申请。如果创业项目涉及到专利、商标等知识产权问题，可以向知识产权局进行申请。如果需要获得财务资助或政府支持，可以向相关部门如工业和信息化部门、科技部门或的科技局进行申请。

创业者应根据自身的具体情况和需求，选择合适的部门进行申请，以便获得所需的支持和资源。